Os principais factores responsáveis pela diminuição desta espécie nos ultimos séculos foram a perseguição directa movida pelo Homem, a redução das populações de ungulados selvagens e a destruição e fragmentação do habitat.

Em Portugal, as ameaças a que, actualmente, está sujeita a população de lobos são sobretudo a escassez de recursos alimentares (ausência de presas selvagens e/ou regressão da criação de gado em regime alargado), a escassez de áreas de refúgio, a fragmentação do habitat e a mortalidade causada pelo Homem (envenenamento e atropelamento).